Para el torneo apertura del 2003, Alianza Lima apuesta con todo a sus divisiones menores , contando en el primer
equipo
con juveniles tales con Jefferson
Farfán , Wilmer Aguirre, Exar
Rosales, Rinaldo Cruzado , Walter
Vilchez, Alexander Sanchez, los
hermanos Roberto y Guillermo
Guizasola y con ellos la capacidad y
la experiencia del capitán Jose Soto
, la marca implacable de Juan José
Jayo Legario, el empuje de Marko
Ciurlizza , los cambios de ritmo de
Aldo Olcese y la sobriedad de
Gustavo Roverano.
Se logro amalgamar un gran equipo el mismo que se fue con
solidando fecha a fecha, ya con la batuta en la dirección técnica del profesor Gustavo Costas , entrenador argentino el cual su mayor referente es el de mostrar a los juveniles en los equipos en los que dirigió….Alianza Lima no es la excepción.
En este torneo se logro mantener la hegemonía en los clásicos, empatando en la primera rueda y ganando por 2 goles a 1 a universitario de deportes y aumentando la diferencia en el total de clásicos jugados a través de la historia del fútbol peruano.
Lamentablemente nos fue esquiva la posibilidad del título, puesto que se dieron muchísimas razones que entorpecieron la labor del comando técnico como por ejemplo las
convocatorias de la selección peruana para los partidos previos a la eliminatoria al mundial Alemania 2006, al tener el mejor plantel del fútbol peruano para cada convocatoria se contaba hasta con 9 jugadores de Alianza Lima, lo que hacia complicada la labor del comando técnico. Se llego al final del apertura en segundo lugar esperando conseguir el titulo del clausura para forzar la definición Play- Off con Sporting Cristal, campeón del torneo apertura 2003.
Empezamos el torneo clausura 2003 sin el concurso en el primer equipo de Henry Quinteros quien fichara por Sporting Cristal , pero se mantuvo la columna vertebral del mismo ya que no se sufrió ninguna otra baja y el profesor Costas le brindo toda la confianza al juvenil Junior Viza quien al lado de Aldo Olcese se encargaron de la volante de creación en el equipo.
En este torneo y como ya es costumbre se derroto por enésima vez a nuestro compadre y rival deportivo , lo que confirma el paternalismo del equipo del pueblo sobre el equipo de la vocal.
Alianza logró un nivel importante de juego basado en la velocidad de sus jugadores, en su mayoría juveniles destacando nítidamente en el torneo Jefferson Farfán , nivel que nos colocara en el primer lugar del campeonato en solo algunas fechas de jugado.
Al final de la primera rueda , Alianza Lima se ubico en el primer puesto seguido por el Alianza Atlético de Sullana., el equipo siguió por la senda del triunfo pero lamentablemente se vio truncada la posibilidad de continuar el campeonato por problemas con la agremiación de jugadores quienes decretaron una huelga indinida lo que obligó a los miembros de la ADFP a continuar el torneo con las categorías Sub 20 , pero esto trajo mayores inconvenientes y la federación mediante una resolución dio por concluido el torneo clausura dando como campeón a Alianza Lima por la ubicación en que se encontraba al momento de la suspensión y por el puntaje acumulado a lo largo de todo el año.
Luego de muchos debates entre los miembros de la ADFP , agremiación de futbolistas y Federación Peruana de Fútbol se levantó la huelga y la federación programó el partido de definición del torneo 2003 entre Sporting Cristal ,Campeón torneo apertura vs. Alianza Lima, campeón torneo clausura para determinar el campeón nacional 2003 programado para el sábado 31 de enero del año 2004.
Esa fecha , Alianza demostró que debió 
ser justamente campeón por lo que dejó en la cancha, y con el
gra desempeño de todos, especialmente los juveniles, derrotaron a
Sporting Cristal . José Soto, del Cristal y Roberto Silva, de Alianza, fueron los autores de los goles que definieron el empate en el primer tiempo reglamentario del partido. Sin embargo, fue en el tiempo suplementario que Farfán anotó el tanto que dejaría el triunfo en manos del plantel aliancista.
Luego
de este vibrante encuentro empezó
el torneo Apertura 2004 , Los íntimos
iniciaron el Apertura ante Atlético
Universidad con buen pie, con un
triunfo en Matute. En los siguientes
partidos, el saldo siguió siendo
bueno. Un empate de visita ante
Vallejo, un triunfo en Matute ante
‘Bolo’ y un empate en Sullana
ante A. Atlético.
La
quinta fecha fue especial para
Alianza. Enfren
taron a un Sporting
Cristal con muchos elementos jóvenes
y los apabullaron sin compasión por
5-0, con dos dianas de Sáenz.
Al término de la primera rueda,
Alianza recibió un gran golpe en
casa al caer por 1-0 ante Cienciano,
aunque, sin embargo, la punta siguió
siendo suya. Ya recuperado del
traspié, el equipo blanquiazul no
tuvo piedad en Ica con Bolognesi y
lo goleó por 6-1.
Hasta
que llegó el partido del título:
fecha 18. Los íntimos ganaron con
justicia a Cristal (1-0) y
aseguraron prácticamente el
Apertura,
así en la siguiente
jornada hayan caído por 4-0 en
Juliaca ante Melgar. Los triunfos
posteriores sobre Huaral, Wanka, San
Martín, Grau Estudiantes y
Universitario sirvieron para
consolidar el objetivo.
Cuando llegó el cotejo ante
Cienciano en Cusco, por la última
fecha del torneo, Alianza Lima ya
era campeón, pues había celebrado
ante los ‘merengues’ por
anticipado (tenían una ventaja de
cinco puntos sobre el segundo) y ya
todo estaba dicho.
Para
el clausura se fue Jefferson Farfán
y Alianza Lima sufrió
inconvenientes. Si bien inició el
segundo torneo con una victoria ante
Atlético Universidad, en adelante,
es decir hasta la octava fecha, no
supo de alegrías, y todo, debido a
la falta de delanteros y nula
definición.
Pese
a los triunfos sobre Wanka, Grau
Estudiantes y San Martín, en fila,
Alianza volvió a caer en la fecha
11 ante Boys, así también obt
uvo
sendos empates ante la ‘U’ y
Cienciano antes de terminar la
primera rueda, lejos del primer
lugar.
Consciente que tenía que levantar,
Alianza tuvo un buen inicio en la
segunda rueda con cinco resultados
favorables, incluido una victoria
sobre Cristal, el gran candidato, y
que le permitió ascender al tercer
puesto y volver a soñar con el título,
pero sólo fue un deseo.
Ante
Melgar, la fecha siguiente, volvió
a mostrar muchas
dudas y cayó sin
atenuantes. La meta, ahora, sólo
pasaba por ubicarse entre los seis
primeros para disputar el Play
Off
contra Sporting Cristal, objetivo
que casi no logra pues las derrotas
ante Boys y Universitario asustaron
más de la cuenta.
Y
llegó el partido ante Cienciano, el
último en Cusco, el que definía
todo para Alianza Lima. Quedará en
el recuerdo el gol del empate en los
pies de Aldo Olcese, quien anotó en
valla rival cuando tuvo que hacer
gala de su Fair Play.
Y
llego el dia definitorio del
Campeonato. Alianza dio la última
lección de corazón valiente en
este durísimo campeonato, al
enfrentar a un Sporting Cristal
relajado y descansado, pero que vio
como con 'corazón para ganar' los
aliancistas escondían su desgaste y
lesiones para inclinar la cancha a
su favor. Porque, aunque la definición
fue por penales, lo cierto es que
Alianza Lima fue muy superior a un
Sporting Cristal timorato y
excesivamente conservador.
Sólo
el primer tiempo Cristal insinuó
peligro sobre la valla de un enorme
Butrón, con algún remate de 'el
Pato' Quinteros y un desborde de
Juan Cominges.
Para
el segundo tiempo, creció la figura
de Jayo, que reaparecía después de
una lesión y los victorianos
encontraron el equilibrio y la
pelota para generar peligro. Pero lo
mejor de Cristal estuvo en el fondo,
pese a la temprana expulsión de
Villalta, superieron recuperarse y
controlaron los avances aliancistas.
Cristal
quería que los minutos pasen y
soportaba, como todo el segundo
tiempo y los treinta minutos del
suplementario, los improductivos
embates blanquiazules, que fueron el
talón de aquiles desde que
perdieran a su perla negra,
Jefferson Farfán.
Y
se le dio a Cristal. Acabó el
partido y la cosa estaba para
cualquiera.
En
la ronda de penaltis anotaron los
aliancistas José Soto, Martín
Hidalgo, Juan Jayo, Marko Ciurlizza
y Guillermo Salas, mientras que
fallaron Flavio Maestri y Waldir Sáenz.
Por
el Cristal anotaron Carlos Zegarra,
Jorge Soto, Amilton Prado y Erick
Torres, y erraron sus tiros Juan
Cominges, José Moisella y Norberto
Araujo.
Premio
al corazón que le puso Alianza para
querer
ganar en base a sacrificio y
el aliento ensordecedor del 70 por
ciento del estadio. Con este titulo
se logro el ansiado BICAMPEONATO.